TCGA拼接序列
| 概述 | |
| 说明 | 一种研究TCGA肿瘤及其邻近正常组织mRNA剪接的工具 |
| 开发信息 | |
| github | 安德森生物信息学博士/拼接序列 |
| 统一资源定位地址 | https://bioinformatics.mdanderson.org/TCGASpliceSeq/ |
| 语言 | HTML、Javascript、MySQL |
| 当前版本 | 2 |
| 平台 | 独立于平台 |
| 许可证 | 免费供学术和商业使用。 |
| 状态 | 活跃的 |
| 上次更新时间 | 2016年8月 |
| 工具书类 | |
| 引用 | Ryan M、Wong WC、Brown R、Akbani R、Su X、Broom B、Melott J、Weinstein J，TCGA剪接：癌症中mRNA选择性剪接概要. 核酸研究（数据库问题）4（D1）pD1018（2016年）。https://doi.org/10.1093/nar/gkv1288 |
| 帮助和支持 | |
| 联系人 | Insilico公司 |
| 讨论 | 关于GitHub的问题 |
TCGA拼接序列
TCGA拼接序列是一个基于web的资源，它提供了一个快速、用户友好、高度可视化的资源，用于探索TCGA肿瘤的选择性剪接模式。来自33种不同肿瘤类型的样本（包括可用的相邻正常样本）的拼接事件百分比（PSI）值已加载到TCGA拼接序列中。研究人员可以询问感兴趣的基因，寻找在所选肿瘤类型之间或之间表现出最强差异的基因，或者探索肿瘤和相邻正常样本之间剪接模式的变化。该界面提供了拼接模式、读取计数和各种统计摘要（包括拼接百分比）的直观图形表示。拼接数据也可以下载，以纳入综合分析。
