突发事务所
| 概要 | |
| 描述 | BREACTRANS将基因融合映射到癌细胞中的基因组结构 |
| 发展信息 | |
| 语言 | Perl. |
| 当前版本 | 0.0.6 |
| 执照 | gpl v3 |
| 状态 | 活性 |
| 最近更新时间 | 2013/02/13 |
| 参考资料 | |
| 引文 | 陈，K.，Navin，N.E.，Wang，Y.等。BREAKTRANS：揭示基因融合的基因组结构那基因组生物学v。14 p r87（2013）https://doi.org/10.1186/gb-2013-14-8-r87 |
| 帮助和支持 | |
| 联系 | 肯陈 |
突发事务所
BREAKTRANS是一种计算机程序，将预测的基因融合映射到基因组结构重排，以便验证两种类型的事件并提供机制/功能解释。它需要从至少一个基因融合预测程序（例如Tophat-Fusion，defuse和沉降）和至少一个基因组断点检测程序（例如突发师和波峰）。
下载
BreakTrans包包括每个特定癌症的两个部分，可执行文件和注释数据文件。要运行它，用户需要下载可执行文件和注释数据库。
可执行包（6.5 kB）
注释数据库（184 MB）
乳腺癌细胞系SK-BR-3的测试数据集（673 kB）