MicroArray Go Browser用户指南
基因本体浏览器工具提供了一种分析微阵列数据的方法。鉴于阵列上的“有趣”斑点列表，它将基因与人类可解释的形式相关联而代之的功能。选择树节点使其基因本体被映射回相关基因，每个基因被相应的基因符号和名称显示在列表中。列出项目用作Web浏览器在NCBI的Web浏览器中的超链接。
用户界面
基因本体浏览器（如下所示）是MDI样式Java应用程序。此样式类似于Microsoft Word等应用程序，允许同时使用多个文档。打开文档列在窗口下拉菜单中，其中包含在活动（选定）文档之前的复选标记。
每个文档包含来自微阵列数据的实验结果的树视图。打开文档创建一个新窗口，其中包含标题栏中显示的文档标题以及显示的任何备注描述控制板。这实验条款面板显示与实验结果相关的基因本体论术语的层次视图。每个术语以其累积和纯频率之前（括号）显示。从树中选择一个或多个术语将导致要查找的关联轨迹ID，并在滚动列表中显示它们的符号/名称相关基因控制板。双击滚动列表中的项目将启动Web浏览器，该Web浏览器将显示项目的LocuSLink信息。刀具提示显示两个基因本体术语和locuslink符号的登录ID。
基因本体浏览器
“文件挂例”菜单包含所有通用文件处理选项。
- 新的...：创建新的实验结果数据文件。
- 打开...：打开现有的实验结果数据文件。
- 关闭：关闭当前的实验结果窗口。
- 出口。：导出与所选节点的实验结果树层次结构相关的数据。尚未被堵塞。
- 打印。：打印实验结果树层次结构。目前已禁用。
- 辞职：退出应用程序。
外观下拉菜单包含外观修改选项。它允许通过Protright菜单选择更改应用程序的外观和感受。
- 外观和感觉：将应用程序的外观和感觉设置为平台依赖于平台。菜单选项将根据应用程序运行的位置而异。金属，跨平台外观和感觉，是默认设置。
- 主题：设置金属外观和感觉使用的主题。主题允许控制此外观的许多属性，包括颜色和字体。
窗口下拉菜单包含所有通用窗口处理选项和打开文档列表。
- 级联：将所有文档Windows堆叠在级联中。
- 瓷砖水平：从左到右堆叠所有文档窗口。
- 瓷砖垂直：将所有文档窗口堆叠到底部。
- 文件：所有打开文档窗口的动态列表。在所选（前面的）文档旁边显示选中的框。
帮助下拉菜单包含在使用该应用程序时提供基本帮助的所有选项。
- 概述：提供应用目的的高级描述。
- 用户指南：通过Web浏览器显示此文档。
- 关于：提供有关应用程序本身的信息。
- 环境变量：
- 回家：设备的根目录。强制的。
- 戈塔：存在实验结果数据文件的替代目录。默认为*\ $ gohome./ data *目录如果未设置。
- Goimport：导入包含轨迹ID的ASCII文件的替代目录。默认为$ Godata.目录如果未设置。
- 文件：
- go.xml：包含基因本体数据的XML文件。
- .xml：包含实验结果数据的XML文件。
- .txt：包含轨迹ID的ASCII文件，每行一个，可以导入，以创建实验结果数据文件。
- 命令行激活：
java.
- dgobrowser.home.=pathname.指定与\ $ gohome相同的事情
- dgobrowser.data.=pathname.指定与\ $ godata相同的事情
- dgobrowser.import.=pathname.指定与\ $ goimport相同的事情
- djava.rmi.server.hostname.=localhost.指定RMI注册表正在运行的主机的符号名称
- djava.security.policy.=java / policy / gobrowser.policy指定Java安全策略文件
- 罐Java / Jars / Gobrowser.jar指定GUI应用程序存档
[文件名]指定要在启动时打开的XML数据文件