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      布莱恩巴塞洛缪形象

      布莱恩巴塞洛缪博士。

      基础科学学部表观遗传学和分子癌变学系

      目前职务及所属单位

      主要的约会

      德克萨斯大学安德森癌症中心表观遗传学和分子癌变学系教授

      188bet体育网址研究兴趣

      我的研188bet体育网址究兴趣是atp依赖的染色质重塑复合物的结构和功能及其核小体动员和重组机制。考虑到这些复合物的大小和复杂性,我的实验室有必要研究重塑体与其核小体底物之间的物理相互作用。我采用了化学生物学的方法,应用了靶向蛋白质和DNA修饰来绘制特定的蛋白质-蛋白质和蛋白质-DNA接触图。附着在特定靶位点的报告分子有光化学型、蛋白水解型和荧光型。我的实验室使用酿酒酵母作为我们的模型系统,因为一旦一个特定的联系被发现和映射,我们能够改变该地区的体内蛋白质和发现这些突变对染色质结构和功能的影响,以及影响其体外生化活动。

      我正在应用相关的方法来检查核小体在重塑时结构的变化,并开发了一种方法来监测组蛋白八聚体中几个位置与核小体DNA的相互作用。我的实验室正在扩展和改进这项技术,以获得更多关于核小体结构的时间变化的信息。我也有兴趣使用单分子方法来检查核小体重塑,并参与了两个合作,使用单分子荧光共振能量转移和DNA甲基化可及性与亚硫酸氢盐测序来检查SWI/SNF和ISW2重塑。我感兴趣的是发现组蛋白修饰的作用,如乙酰化和甲基化在染色质重塑的招募和调节。我也参与研究组蛋白伴侣与atp依赖的染色质重塑的相互作用。

      教育和培训

      授予学位教育

      1988 美国加州大学戴维斯分校,化学博士
      1982 杨百翰大学,普罗沃,UT,美国,理学学士,化学

      选定的出版物

      同行评议的文章

      1. Hada A, Hota SK, Luo J, Lin YC, Kale S, Shaytan AK, Bhardwaj SK, Persinger J, Ranish J, Panchenko AR, Bartholomew B.组蛋白八聚体结构在ISW2 at依赖性核小体重塑早期发生改变。细胞代表28(1):282 - 294。e6, 2019年。PMID: 31269447。
      2. Brahma S, Ngubo M, Paul S, Udugama M, Bartholomew B.Arp8和Arp4模块作为DNA传感器控制INO80染色质重塑。中国科学(d辑):地球科学(英文版),2018。e-Pub 2018。PMID: 30120252。
      3. Brahma S, Udugama MI, Kim J, Hada A, Bhardwaj SK, Hailu SG, Lee TH,巴塞洛缪B.H2A INO80交流。Z表示H2A,通过在组蛋白二聚体的DNA近端易位。Nat Commun 8:15616, 2017。e-Pub 2017。PMID: 28604691。
      4. Sen P, Luo J, Hada A, Hailu SG, Dechassa ML, Persinger J, Brahma S, Paul S, Ranish J,巴塞洛缪B.Snf5的缺失诱导了异常SWI/SNF复合物的形成。中国生物医学工程学报,2017,32(9):2135-2147。PMID: 28249160。
      5. 普拉萨德·R达西·S哈达·A卢格·K巴塞洛缪B.Nap1和RSC在串联核小体解体中的协同作用。中国生物医学工程学报,2016,35(4):531 - 534。e-Pub 2016。PMID: 27273866。
      6. Harada BT, Hwang WL, Deindl S, Chatterjee N,巴塞洛缪B壮族X.RSC重塑复合物的逐步核小体易位。Elife 2016。e-Pub 2016。PMID: 26895087。
      7. Creamer KM, Job G, Shanker S, Neale GA, Lin YC,巴塞洛缪B,鹧鸪摩根富林明.Mi-2同源物Mit1在异染色质中积极定位核小体抑制转录。中国生物医学工程学报,2017,32(11):2046- 2061,2014。e-Pub 2014。PMID: 24662054。
      8. 巴塞洛缪B.INO80重构所需的单体肌动蛋白。中国生物医学工程学报20(4):405- 413,2013。PMID: 23552289。
      9. Hota SK, Bhardwaj SK, Deindl S, Lin YC, Zhuang X,巴塞洛缪B.ISW2的核小体动员需要atp酶和SLIDE结构域的协同作用。中国生物医学工程学报20(2):222- 9,2013。e-Pub 2013。PMID: 23334290。
      10. Sen P, Vivas P, Dechassa ML, Mooney AM, Poirier MG,巴塞洛缪B.SWI/SNF的SnAC结构域是重塑所需的组蛋白锚点。中国生物医学工程学报33(2):360- 70,2013。e-Pub 2012。PMID: 23149935。
      11. Deindl S, Hwang WL, Hota SK, blossom TR, Prasad P,巴塞洛缪B壮族X.ISWI通过协调的多碱基对进入步骤和单碱基对退出步骤来滑动核小体。细胞152(3):442 - 52岁,2013年。PMID: 23374341。
      12. Dechassa ML, Hota SK, Sen P, Chatterjee N, Prasad P,巴塞洛缪B.SWI/SNF和ISW2的DNA转位酶结构域差异。中国生物医学工程学报,2012,29(10):1417 - 1421。e-Pub 2012。PMID: 22298509。
      13. Hota SK, Bartholomew B.通过atp依赖的染色质重塑复合物研究核小体运动的方法。方法:中华医学杂志809:367- 80,2012。PMID: 22113289。
      14. Hota SK, Dechassa ML, Prasad P,巴塞洛缪B.atp依赖的染色质重塑的蛋白质- dna和蛋白质-蛋白质相互作用。方法:中国生物医学杂志809:381-409,2012。PMID: 22113290。
      15. Darst RP, Pardo CE, Pondugula S, Gangaraju VK, Nabilsi NH,巴塞洛缪B, Kladde议员.利用MAPit同时检测内源性C-5 DNA甲基化和染色质可及性。方法:中国生物医学工程杂志,2012。PMID: 22183592。

      邀请的文章

      1. 巴塞洛缪B.atp依赖的染色质重塑的调节:加速器/制动器,锚和传感器。生物化学学报46(6):1423-1430,2018。e-Pub 2018。PMID: 30467122。
      2. 孟H,巴塞洛缪B.转录增强子在染色质环化和RNA聚合酶启动子近端暂停中的新角色II。中国生物化学学报23(3):417 - 418,2018。e-Pub 2017。PMID: 29187597。
      3. 巴塞洛缪B.超越蛋白质水解的蛋白酶体:在异染色质维持中的作用。中国生物化学(英文版),2017,33(4):514 - 514。PMID: 29030538。
      4. 巴塞洛缪B.ISWI染色质重塑:一个主要因素还是一个协调的努力?Curr Opin Struct Biol 24:150- 5,2014。e-Pub 2014。PMID: 24561830。
      5. 巴塞洛缪B.染色质景观的调控:结构和机制的观点。生物化学学报83:671- 96,2014。e-Pub 2014。PMID: 24606138。
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