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      谊文陈形象

      谊文陈

      生物信息学和计算生物学、基础科学分工

      现在的标题和归属

      主要的约会

      助理教授、生物信息学和计算生物学的定量科学分工,德克萨斯大学MD安德森癌症中心,休斯顿,德克萨斯州

      参议员,生物信息学和计算生物学的部门,部门分工科学,德克萨斯大学MD安德森癌症中心,休斯顿,德克萨斯州

      188bet体育网址研究兴趣

      利用综合计算和multi-omic(基因组,外遗传性、转录组和蛋白质组)方法,我集团的长期目标是解读rna介导的机制在癌症发病机理关注RNA-based基因调控

      在这两种肿瘤(如癌症干细胞)和免疫细胞。在转化研究方面,我的小组旨在识别可能提供的188bet体育网址rna

      作为目标预测生物标记和免疫治疗和发展

      RNA-based针对性和免疫治疗治疗难治性癌症类型

      胶质母细胞瘤(GBM)多元化,非小细胞肺癌(NSCLC)和三阴乳腺癌(TNBC)。

      教育和培训

      授予学位教育

      2007年 教堂山北卡罗来纳大学教堂山分校,数控,美国物理学博士/生物物理学
      2000年 复旦大学、上海、中文、BS、物理

      研究生培训

      2009 - 2015 188bet体育网址研究奖学金,丹娜-法伯癌症研究所,哈佛大学公共卫生学院,波士顿,MA
      2007 - 2009 188bet体育网址研究奖学金、哈佛医学院、波士顿,MA

      体验和服务

      其他的约会/责任

      常规的教员,生物医学科学研究生院,德克萨斯大学休斯顿健康科学中心和德克萨斯大学MD安德森癌症中心,休斯顿,TX, 2017年至今

      荣誉和奖励

      2013年 NIH (NCI) K99 / R00通路独立奖,国家卫生研究院(NCI)

      选定的出版物

      同行评议的文章

      1. 许他D,张P Y,侯J,潘BF,王Y,刘T,戴维斯厘米,Ehli EA,谭L,周F,胡锦涛J,于Y,陈X,阮TM,罗森JM,霍克DH,霁Z,陈Y。全基因组识别和微分平移启动分析。Nat Commun 8 (1): 1749、2017。e-Pub 2017。PMID: 29170441。
      2. 范T *,陈Y *李(co-first作者)、小T W,卡托L P,销MB,鲍登M, Lis RT,赵SG,吴Q,冯,财政年度Loda M,他HH,刘XS,布朗M。全基因组CRISPR屏幕识别HNRNPL作为前列腺癌依赖性调节RNA拼接。《美国国家科学院刊年代114 (26):E5207-E5215, 2017年。e-Pub 2017。PMID: 28611215。
      3. L Shingu T, Ho,元,周X,戴C,郑年代,王问,钟Y,常问,霍纳JW, Liebelt BD,姚明Y, B,胡陈YFuller GN Verhaak RG, heimberg, AB,胡锦涛J。Qki缺乏具备干细胞保持环境不佳的神经胶质瘤干细胞表达下调endolysosomal退化。Nat麝猫49 (1),2017。e-Pub 2016。PMID: 27841882。
      4. Du Z,太阳T,范Hacisuleyman E T,王X,布朗M, Rinn杰,李毫克,陈Y #(共同通讯作者),Kantoff PW #,刘XS #。综合分析揭示了长non-coding-RNA介导海绵在前列腺癌的监管网络。Nat Commun 7:10982, 2016年。e-Pub 2016。PMID: 26975529。
      5. 范谢长廷CL, T,陈Y王,李T,高Y, X,太阳T, Sweeney CJ,李GS,陈年代,犹豫SP,刘XS,布朗M, Kantoff PW。增强器rna参与雄激素receptor-driven循环,选择性地增强基因激活。《美国国家科学院刊年代111 (20):7319 - 2014。e-Pub 2014。PMID: 24778216。
      6. 陈X, Iliopoulos D,张问,唐问,格林布拉特MB, Hatziapostolou M, Lim E, Tam西城,倪,陈Y沈,Mai J, H,胡锦涛DZ, Adoro年代,胡锦涛B,歌M,谭C,兰迪斯博士法拉利M,胫骨SJ,布朗M, Chang JC,刘XS,格里姆彻LH。通过控制HIF1αXBP1促进三阴性乳腺癌途径。自然508 (7494):103 - 2014。e-Pub 2014。PMID: 24670641。
      7. 陆T,阿伦L, Zullo J,潘Y,金正日H,陈Y金,杨,嗯,德雷克D,刘XS,贝内特哒,Colaiacovo MP,杨克纳英航。休息和压力电阻老化和老年痴呆症。自然507 (7493):448 - 2014。e-Pub 2014。PMID: 24670762。
      8. 范Du Z, T, Verhaak RG,苏Z,张Y,棕色,陈Y #(共同通讯作者),刘XS #。综合基因组分析揭示临床相关的长非编码rna在人类癌症。Nat Struct杂志20 (7):908 - 2013。e-Pub 2013。PMID: 23728290。
      9. 倪,陈Y李,范T, D, Lim E,刘XS,布朗M。雄激素的调幅信号的原癌基因。基因Dev 27(7): 734 - 48, 2013年。e-Pub 2013。PMID: 23530127。
      10. Landt编著SG, Marinov门将,Kundaje Kheradpour P,泡利F, Batzoglou年代,伯恩斯坦,Bickel P,布朗JB, Cayting P,陈Y,迪沙佛G,爱泼斯坦C, Fisher-Aylor KI, Euskirchen G,格斯坦M,格茨J, Hartemink AJ,霍夫曼MM,艾耶VR,荣格YL, Karmakar年代,凯利斯M, Kharchenko PV,李问,刘,刘XS,马L, Milosavljevic,迈尔斯RM,公园PJ, Pazin MJ,佩里医学博士Raha D, Reddy TE, Rozowsky J, Shoresh N, Sidow, Slattery M, Stamatoyannopoulos是的,Tolstorukov,白色KP, Xi年代,萨利PJ, Lieb JD,荒原BJ,斯奈德M。modENCODE ChIP-seq指导原则和实践的编码和财团。基因组Res 22(9): 1813 - 31日,2012年。PMID: 22955991。
      11. 陈Y李,Negre N, Q, Mieczkowska乔Slattery M,刘T,张Y, Kim TK他HH, Zieba J,阮Y, Bickel PJ,迈尔斯RM,荒原BJ,白色KP, Lieb JD,刘XS。系统评价的影响因素ChIP-seq忠诚。Nat方法9 (6):609 - 2012。e-Pub 2012。PMID: 22522655。
      12. 唐问,陈Y,迈耶C, Geistlinger T, Lupien M,王Q,刘T,张Y,布朗M,刘XS。核受体癌症cistromes的全面视图。癌症Res 71 (22): 6940 - 2011。e-Pub 2011。PMID: 21940749。
      13. 倪M *,陈Y *(co-first作者),Lim E, Wimberly H,贝利圣,Imai Y, Rimm DL,刘XS,布朗M。针对雄激素受体在雌激素受体阴性乳腺癌。癌细胞20(1):119 - 31日,2011。PMID: 21741601。
      14. 陈Y李,Meyer CA,刘T, W,刘JS,刘XS。MM-ChIP支持跨平台的综合分析和between-laboratory ChIP-chip或ChIP-seq数据。R11,基因组医学杂志12 (2):2011。e-Pub 2011。PMID: 21284836。
      15. 刘T,奥尔蒂斯是的,ta L, Meyer CA,李B,张Y,胫骨H,黄党卫军,马J, Lei Y,佩普UJ, Poidinger M,陈Y,布朗Yeung K、M, Turpaz Y,刘XS。Cistrome:一个转录调控研究的综合平台。基因组医学杂志12 (8):R83, 2011年。e-Pub 2011。PMID: 21859476。
      16. Petrotchenko EV,小K,电缆J,陈Y、Dokholyan NV Borchers CH。头猪,一个机油包裹,isotopically编码,荧光交联结构蛋白质组学。摩尔细胞蛋白质组学8(2):273 - 86年,2009年。e-Pub 2008。PMID: 18838738。
      17. 陈Y,Dokholyan NV。自然选择对蛋白质聚合自动调节和必要的蛋白质酵母、苍蝇、蠕虫。另一个星球杂志25 (8):1530 - 2008。e-Pub 2008。PMID: 18503047。
      18. 陈Y坎贝尔SL Dokholyan NV。破译蛋白质动力学从核磁共振数据采样和选择使用显式结构。Biophys J 93 (7): 2300 - 2007。e-Pub 2007。PMID: 17557784。
      19. Serohijos啊,陈Y,丁F, Elston TC, Dokholyan NV。结构模型揭示了能源动力蛋白转导。《美国国家科学院刊年代103 (49):18540 - 2006。e-Pub 2006。PMID: 17121997。
      20. 陈Y,Dokholyan NV。酵母蛋白的协同进化是制约功能模块化。趋势麝猫22 (8):416 - 2006。e-Pub 2006。PMID: 16797778。
      21. 迪克森RD *,陈Y *(co-first作者),丁F,哈雷SD, Prutzman KC,夏勒医学博士,坎贝尔SL, Dokholyan NV。新见解FAK信号基于检测和本地化的脂肪域折叠中间。结构12(12):2161 - 71年,2004年。PMID: 15576030。

      邀请的文章

      1. 太阳王Y,侯J D, M,张P,于Y,陈Y。新兴龙头、癌症的功能和机制。趋势麝猫32 (4):211 - 2016。e-Pub 2016。PMID: 26922301。
      阅读更多
      少

      格兰特&合同支持

      标题: 一个集成的方法来剖析大型非编码RNA的功能网络
      资金来源: NIH / NCI
      角色: 首席研究员

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