遇见尼古拉斯纳文，博士。
尼古拉斯纳文，博士。
遗传学系，基础科学部
关于纳文博士
Navin博士是MD Anderson癌症中心的副教授，在生物信息学部门担任联合任命。他是德克萨斯大学MD安德森癌症中心uthehealth生物医学科学研究生院的教员。他还是CPRIT单细胞基因组中心(Single Core)的主任和MD Anderson的先进技术基因组核心(ATGC)的联合主任。
在Michael Wigler博士的指导下，他在冷泉港实验室进行了研究生训练和博士后训练。在此期间，他发明了第一种用于哺乳动物细胞基因组测序的单细胞DNA测序方法(single - nucleus - sequencing) (Navin et al. 2011, Nature.)。这项工作对建立单细胞基因组学领域起到了关键作用。Navin实验室继续走在单细胞癌症基因组学领域的前沿，他们在三阴性乳腺癌中发现了一个复制数进化的点状模型(Gao et al. 2016，Nature Genetics)，并阐明了乳腺癌进化中的角色突变表型和亚克隆突变(Wang et al. 2014, Nature)。
除了用于分析所得的大规模数据集的创新计算和统计方法之外，纳文纳的小组博士继续开发用于进行单细胞DNA和RNA测序的开发新技术。这些方法正在侵袭，转移和治疗抵抗的背景下研究癌症演变。他的实验室与MD Anderson的领先肿瘤学家和病理学家密切合作，将这些技术转化为诊所，他们准备在降低人类患者的发病率产生重大影响。
Dr. Navin has been the recipient of many prestigious awards in recognition of his work, including the Damon-Runyon Innovator Award, AAAS Wachtel Award, ACS Research Scholar Award, Wilson Stone Award, the Randall Innovator Award and the MD Anderson President’s Award for Research Excellence.
访问纳文博士的实验室网站．查看完整列表纳文博士的出版物．纳文博士,谷歌学者
目前职务及工作关系
主要的约会
德克萨斯大学安德森癌症中心基础科学研究部遗传学系副教授188bet体育网址
德克萨斯大学安德森癌症中心基础科学研究部遗传学系CPRIT单细胞基因组学中心主任188bet体育网址
德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州安德森癌症中心基础科学研究部的遗传学系先进技术基因组学核心核心核心先进科学研究系188bet体育网址
双/共同/兼职的约会
德克萨斯大学安德森癌症中心生物信息与计算生物学副教授
德克萨斯大学MD安德森癌症中心uthehealth生物医学科学研究生院副教授
188bet体育网址研究兴趣
单细胞基因组学;癌症进化;液体活检基因组学;计算生物学
本集团开创了单细胞基因组测序技术的发展，我们申请了解人类癌症中的复杂生物过程，包括肿瘤起始，侵袭，转移和治疗性。我们将癌症作为一种进化过程，其中克隆响应选择性压力而持续选择和扩张。我们理解肿瘤作为一种复杂的生态系统，其通过肿瘤细胞和基质细胞类型之间的复杂的相互作用而维持。我们的使命是获得对癌症演变的新知识，可以利用来提高癌症质量和降低癌症患者的发病率。在MD Anderson，我们是独特的定位，以将基因组技术转化为诊所，在那里他们准备对癌症患者的早期检测，诊断和治疗策略产生重大影响。
教育与培训
授予教育
| 2010年 | 美国纽约冷泉港大学冷泉港实验室，分子遗传学博士 |
| 2003年 | Skidmore College，Saratoga Springs，NY，美国，BS，细胞生物学 |
研究生培训
| 2010 - 2011 | 美国冷泉港实验室癌症遗传学博士后 |
体验和服务
学术任命
德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州安德森大学，休斯顿，TX，2011年，德克萨斯州MD癌症中心大学助理教授
德州大学安德森癌症中心遗传学助理教授，基础科学研究部，休斯顿，德克萨斯州，2011 - 2016188bet体育网址
德克萨斯州德克萨斯州德克萨斯州博士大学助理教授Uthealth生物医学科学院，休斯顿，TX，2011年 - 2016年
荣誉和奖励
| 2019年 | 德州大学安德森癌症中心校长卓越研究奖188bet体育网址 |
| 2019年 | 布拉瓦特尼克生命科学奖，国家决赛选手 |
| 2018年 | 德克萨斯大学教师奖，德克萨斯大学M.D.安德森癌症中心 |
| 2018年 | 达拉斯/沃思堡德克萨斯大学德克萨斯大学德克萨斯大学德克萨斯州癌症中心基础研究的达拉斯/沃思堡188bet体育网址 |
| 2017年 | Jack和Beverly Randall卓越奖癌症治疗，兰德尔家族基金会 |
| 2017年 | 前列腺癌基金会挑战奖 |
| 2017年 | 40岁以下40岁，Stoney Brook大学 |
| 2016年 | 德州大学安德森癌症中心院长学者奖 |
| 2016年 | Sabin奖学金，安德鲁萨宾家族基金会 |
| 2016年 | ACS研188bet体育网址究学者，美国癌症协会（ACS） |
| 2016年 | 总统德克萨斯大学教育卓越的认可，德克萨斯州大学。安德森癌症中心 |
| 2016年 | 教师学者奖，德克萨斯大学M.D.安德森癌症中心 |
| 2015年 | AAAS Martin＆Rose Wachtel奖，美国促进科学促进协会 |
| 2014年 | 德克萨斯大学教师奖，德克萨斯大学M.D.安德森癌症中心 |
| 2013年 | T.C.香港奖，青年调查员奖 |
| 2013年 | 威尔逊·s·斯通纪念奖 |
| 2013年 | 达蒙-鲁尼恩创新者奖，达蒙-鲁尼恩拉克利夫基金会 |
| 2010年 | 年轻的调查员奖，基因组技术杂志 |
| 2009年 | T32 NCI奖学金，国家癌症研究所 |
| 2009年 | 亚伯拉罕奖，石溪大学 |
| 2008年 | 国王和米勒奖学金，石溪大学 |
| 2005年 | Lindsey-Goldberg奖学金，冷泉港实验室 |
选定的出版物
同行评议的文章
- 戴维斯A，高R，纳文N．SCOPIT:单细胞测序实验的样本量计算。生物信息学20(1):566,2019。PMID: 31718533。
- Zafar H，Navin N，Chen K，Nakhleh L.．从单细胞基因组测序数据中对肿瘤克隆的种群结构、基因型和系统发育进行贝叶斯推断。基因组Res(11): 1847 - 1859年,2019年。PMID: 31628257。
- 王F，梁某，Kumar T，Navin N，Chen K.．SCMarker：用于单细胞转录组分析的AB Initio标记选择。PLOS计算BIOL 15（10）：E1007445,2019。PMID：31658262。
- 玉米PG, Heath EI, Zurita A, Ramesh N, Xiao L, Sei E, li - ning tapia E, Tu SM, Subudhi SK, Wang J, Wang X, Efstathiou E, Thompson TC, Troncoso P, Navin N, Logothetis CJ, Aparicio AM．Cabazitaxel Plus Carboplatin用于治疗转移性阉割的前列腺癌症的男性：随机，开放标签，第1-2期试验。柳叶刀牛舞型20（10）：1432-1443,2019。PMID：31515154。
- 张Y，熊，刘B，裤子V，Celii F，Chau G，Elizondo-Fraire Ac，Yang P，You MJ，El-Naggar Ak，Navin Ne，Lozano G．体细胞TRP53突变差异驱动乳腺癌和转移的演变。NAT Commun 9（1）：3953,2018。E-PUB 2018. PMID：30262850。
- Kim C＆Gao R，Sei E，Brandt R，Hartman J，Hatshek T，Crosetto N，Foukakis T和Navin N.．单细胞测序描绘三重阴性乳腺癌中的化学抑制演化。小区173（4）：879-893,2018。PMID：29681456。
- Casasent Ak，Schalck A，Gao R，Sei E，Long A，Pangburn W，Casasent T，Meric-Bernstam F，Edgerton Me，Navin Ne．地形单细胞测序鉴定的乳腺肿瘤中的多链条侵袭。细胞172（1-2）：205-217,2018。PMID：29307488。
- 梁茂林，Davis A, Gao R, Casasent A, Wang Y, Sei E, Vilar E, Maru D, Kopetz, Navin, N．单细胞DNA测序揭示了转移性结直肠癌晚期扩散模型。基因组研究27(8):1287-1299,2017。PMID: 28546418。
- 高河，戴维斯A，麦当劳，SEI E，Shi X，王Y，Tsai PC，赌场A，水域J，Zhang H，Meric-Bernstam F，Michor F，Navin Ne．三阴性乳腺癌的间断拷贝数进化和克隆停滞。2016年12月21日。e-Pub 2016。PMID: 27526321。
- Mann KM, Newberg JY, Black MA, Jones DJ, Amaya-Manzanares F, Guzman-Rojas L, Kodama T, Ward JM, Rust AG, van der Weyden L, Yew CC, Waters JL, Leung ML, Rogers K, Rogers SM, McNoe LA, Selvanesan L, Navin N, Jenkins NA, Copeland NG, Mann MB．用SBCapSeq分析单个髓系白血病细胞的肿瘤异质性和驱动基因。自然生物技术34(9):962-72,2016。PMID: 27479497。
- 陈凯，王勇，王永平，陈凯．单基因:单细胞中单核苷酸变异检测。自然方法,2016年。PMID: 27088313。
- 梁明林，王勇，金诚，高瑞，蒋杰，塞恩，纳文东北．单核高度多路复用目标DNA测序。Nat协议11(2):214- 35,2016。e-Pub 2016。PMID: 26741407。
- 梁敏，王颖，王永明，王永明．单核外显子组测序。基因组生物学25(16):55,2015。PMID: 25853327。
- Molhatra A，王Y，Waters J，Hall I，Navin N．Ploidy-Seq:通过多倍体肿瘤亚群测序推断突变年代。基因组医学7(1):6,2015。PMID: 25729435。
- 王Y，Waters J，unruh A，RoH W，Shi X，Chen K，Scheet P，Vattathil S，Liang H，Multani A，Zhang H，Zhao R，Michor F，Meric-Bernstam F，Navin Ne。．单核基因组测序揭示乳腺癌的克隆进化。自然512(7513):155 - 2014。PMID: 25079324。
- Baslan T，Kendall J，Troge J，Stepansky A，Wigler M，Navin N，Hicks J.．全基因组单细胞拷贝数分析。自然学报7(6):1024- 41,2012。PMID: 22555242。
- Navin N，Kendall J，Troge J，Rodgers L，Cook K，Stepansky A，Levy D，Lee Y，Esposito D，Muthuswamy L，Hicks J，Wigler M．单细胞测序推断肿瘤演进。自然7（472）：90-4,2011。PMID：21399628。
- Malihi PD，Graf RP，Rodriguez A，Ramesh N，Lee J，Sutton R，Jile R，Ruiz Velasco C，Sei E，Kolatkar A，洛奇卢比C，Navin Ne，玉米P，Aparicio Am，Dittamore R，Hicks J，KuhnP，Zurita AJ．单细胞循环肿瘤细胞分析显示出基因组不稳定性作为侵袭性前列腺癌的独特特征。临床癌症Res。E-PUB 2020. PMID：32341031。
邀请的文章
- 王y，navin n．单细胞测序技术的进展与应用。分子细胞58（4）：598-609,2015。PMID：26000845。
拨款及合同支持
| 标题： | 用单细胞测序研究TNBC乳腺癌患者的化疗耐药演化 |
| 资金来源： | Lefkofsky基金会 |
| 角色: | 主要调查员 |
| 标题： | 研究TNBC的突变进化和肿瘤内异质性 |
| 资金来源： | 美国癌症协会（ACS） |
| 角色: | 主要调查员 |
| 标题： | 综合单细胞基因组核心设施 |
| 资金来源： | 德州癌症防治研究所188bet体育网址 |
| 角色: | 主要调查员 |
| 标题： | 利用新的测序技术描述癌症基因组的不稳定性和翻译影响 |
| 资金来源： | 德州癌症防治研究所188bet体育网址 |
| 角色: | 共同 |
| 标题： | 转移乳腺癌和前列腺癌的OMIC和多维空间地图集（OMS Atlas） |
| 资金来源： | NIH / NCI. |
| 角色: | 共同 |
| 标题： | 用空间单细胞基因组学研究肿瘤乳腺癌中肿瘤的启动和侵袭 |
| 资金来源： | NIH / NCI. |
| 角色: | 主要调查员 |
| 标题： | 用单细胞基因组学划定乳腺癌中化学抑制的演变与生态学 |
| 资金来源： | NIH / NCI. |
| 角色: | 主要调查员 |
| 标题： | 人乳房母乳细胞阿特拉斯种子网络 |
| 资金来源： | 陈扎克伯格倡议 |
| 角色: | 主要调查员 |
| 标题： | 转移性乳腺癌患者治疗性的空间 - OMIC分析 |
| 资金来源： | NIH / NCI. |
| 角色: | 共同 |
| 标题： | 利用单细胞基因组学描述乳腺癌her2靶向治疗耐药性的进化 |
| 资金来源： | UTMDACC姐妹机构网络基金 |
| 角色: | 主要调查员 |
| 标题： | EGLN抑制介导肠辐射保护改善不可切除胰腺癌的临床预后 |
| 资金来源： | NIH / NCI. |
| 角色: | 共同 |
| 标题： | AML / MDS Moon Shot |
| 资金来源： | UTMDACC Moon Shot Program |
| 角色: | 共同 |
| 标题： | 前列腺癌月亮拍摄 |
| 资金来源： | UTMDACC Moon Shot Program |
| 角色: | 共同 |
| 标题： | 乳腺癌月球照片 |
| 资金来源： | UTMDACC Moon Shot Program |
| 角色: | 共同 |
| 标题： | LC170171小细胞肺癌（SCLC）中肿瘤异质性和治疗性 |
| 资金来源： | 国防部(DOD) |
| 角色: | 共同 |
| 标题： | 预防导管癌原位浸润性过度治疗现在-精确 |
| 资金来源： | 英国癌症研究中188bet体育网址心 |
| 角色: | 共同 |